Analiza kompleksów białkowych i partnerów interakcji – co-IP i pull-down

Usługa obejmuje identyfikację białek tworzących kompleksy oraz analizę partnerów interakcji w próbkach pochodzących z co-IP, affinity purification i pull-down, BioID oraz DNA/RNA pull-down. Odpowiednio dobrane kontrole pozwalają odróżnić swoiste interakcje od białek stanowiących tło.

Pracownia posiada rozbudowany park maszynowy, w tym wysokorozdzielczy spektrometr Orbitrap Astral wykorzystywany do tych analiz.

Zakres usługi obejmuje:

przygotowanie próbek do LC-MS/MS, obejmujące trawienie białek oraz usuwanie detergentów, soli i innych substancji niekompatybilnych ze spektrometrią mas;
analizę próbek po co-IP, pull-down, BioID i DNA/RNA pull-down, w tym materiału poddanego wcześniej crosslinkingowi, jeśli wymaga tego projekt;
pomiary DIA lub DDA na spektrometrze Orbitrap Astral oraz identyfikację białek, ocenę wzbogacenia względem kontroli i analizę różnicową.

Analizy wykonuje zespół z ponad 25-letnim doświadczeniem w proteomice. Pracownia Spektrometrii Mas jako platforma MASSTRIM znajduje się na Polskiej Mapie Infrastruktury Badawczej.

Pracownia posiada rozbudowany park maszynowy, w tym wysokorozdzielczy spektrometr Orbitrap Astral wykorzystywany do tych analiz.

Zakres usługi obejmuje:

przygotowanie próbek do LC-MS/MS, obejmujące trawienie białek oraz usuwanie detergentów, soli i innych substancji niekompatybilnych ze spektrometrią mas;
analizę próbek po co-IP, pull-down, BioID i DNA/RNA pull-down, w tym materiału poddanego wcześniej crosslinkingowi, jeśli wymaga tego projekt;
pomiary DIA lub DDA na spektrometrze Orbitrap Astral oraz identyfikację białek, ocenę wzbogacenia względem kontroli i analizę różnicową.

Analizy wykonuje zespół z ponad 25-letnim doświadczeniem w proteomice. Pracownia Spektrometrii Mas jako platforma MASSTRIM znajduje się na Polskiej Mapie Infrastruktury Badawczej.