Analiza modyfikacji potranslacyjnych białek, w tym fosfoproteomika

Usługa obejmuje identyfikację i lokalizację różnych modyfikacji potranslacyjnych białek, m.in. fosforylacji, ubikwitylacji, acetylacji, metylacji, oksydacji oraz modyfikacji cystein. Analizowane mogą być pojedyncze białka lub całe proteomy.

W zależności od celu badania możliwe są:

• wzbogacanie fosfopeptydów;
• pomiary DIA albo DDA, opcjonalnie z wykorzystaniem FAIMS Pro;
• analiza oksydacji i mostków disiarczkowych bezpośrednio lub z zastosowaniem sekwencyjnej alkilacji;
• kontrola FDR, lokalizacja miejsca modyfikacji i analiza ilościowa w oprogramowaniu dobranym do rodzaju PTM.

Badania prowadzi zespół mający doświadczenie w analizie różnych modyfikacji potranslacyjnych. Zaplecze stanowi Pracownia rozwijająca proteomikę od ponad 25 lat oraz infrastruktura platformy MASSTRIM z Polskiej Mapy Infrastruktury Badawczej.