Peptydomika i immunopeptydomika – analiza peptydów MHC/HLA

Peptydomika obejmuje identyfikację naturalnie występujących peptydów w płynach biologicznych, tkankach i innych materiałach. Immunopeptydomika jest ukierunkowana na peptydy prezentowane przez MHC/HLA klasy I lub II, m.in. w badaniach nowotworów, zakażeń i odpowiedzi immunologicznej.

Zakres usługi obejmuje:

• pomiary DDA z wykorzystaniem FAIMS Pro albo pomiary DIA na systemie Evosep One–Orbitrap Astral;
• analizę DIA z biblioteką spektralną lub w trybie library-free oraz tworzenie bibliotek peptydomu;
• przeszukiwanie niespecyficzne z użyciem baz gospodarza, patogenu albo białek badanych;
• identyfikację i względną analizę ilościową peptydów.

Analizy wykonuje zespół mający doświadczenie w peptydomice i immunopeptydomice. Metody te są rozwijane w Pracowni działającej w obszarze proteomiki od ponad 25 lat i funkcjonującej jako platforma MASSTRIM.