Proteomika pojedynczych komórek i małych ilości materiału – single cell i low input

Usługa obejmuje analizę proteomu pojedynczych komórek, próbek low-input oraz materiału pozyskanego z określonych obszarów tkanek w eksperymentach spatial proteomics. Workflow jest dobierany do ilości materiału i wymaganej rozdzielczości przestrzennej.

Analizy są wykonywane na wysokoczułym systemie Evosep One–Orbitrap Astral.

Zakres usługi obejmuje:

• miniaturyzację preparatyki i zastosowanie procedur low-loss ograniczających adsorpcję oraz utratę próbki;
• szybkie i czułe pomiary LC-MS/MS, przede wszystkim w trybie DIA, opcjonalnie z wykorzystaniem FAIMS Pro;
• kontrolę jakości, identyfikację i analizę ilościową białek z uwzględnieniem specyfiki danych single-cell i low-input.

Zespół Pracowni specjalizuje się w proteomice i rozwija metody single-cell, low-input oraz spatial proteomics. Pracownia ma ponad 25 lat doświadczenia w analizach proteomicznych i dysponuje infrastrukturą platformy MASSTRIM znajdującej się na Polskiej Mapie Infrastruktury Badawczej.